La dottoressa Erin Chu, è una genetista veterinaria in Embark Veterinary, un dottore in medicina veterinaria, un dottore in genetica molecolare della Cornell University e una mamma di cani per una combinazione Labrador-Shepherd-Chow Chow, Shiloh.
Avevamo alcune domande scottanti sui test del DNA del cane e ci sentiamo fortunati ad aver scoperto un esperto a cui rispondere! Siamo così entusiasti che la dottoressa Chu abbia preso del tempo dal suo frenetico programma per rispondere alle nostre domande sul DNA del cane e aiutarci a capire meglio come funziona. Continua a leggere per saperne di più su come si diventa genetisti, quanto sono accurati i test del DNA dei cani, come differiscono dagli umani e altro ancora mentre approfondiamo questo argomento.
Che Cos’è Un Genetista Veterinario E Cosa Fa Esattamente?
Faccio un po’ di tutto! Una specie di Jill di tutti i mestieri.
Aiuto i clienti di Embark a interpretare i loro risultati, sia che stiano cercando di osservare come i ceppi che abbiamo identificato si siano uniti per creare il loro unico cane da rifugio, sia che siano un allevatore che cerca di ottimizzare i tratti o la salute genetica della loro prossima cucciolata.
Sono un punto di contatto per i nostri collaboratori di ricerca. Abbiamo molti veterinari, allevatori e scienziati che desiderano utilizzare le nostre soluzioni per promuovere la propria scienza. Im addestrato come un genetista molecolare (sto ricevendo il mio Ph . D. in genetica molecolare in questa stagione), così ho anche aiuto sotto l’aspetto laboratorio bagnato del nostro lavoro. Ciò comporta la convalida di alcuni dei risultati del nostro chip* e l’ottimizzazione dei nostri processi di raccolta ed estrazione del DNA. *Il DNA nel campione di saliva viene estratto e preparato dal laboratorio, quindi eseguito sul chip Embarksingle nucleotide polymorphisms (SNP).
Scrivo contenuti educativi e medici presenti sulle pagine dei nostri prodotti e nel nostro sito web. Intendo anche Imbarcarsi in scuole veterinarie, conferenze e ospedali oltre a eventi speciali come Animal Planets Puppy Bowl 2017, che è stato un vero spasso.
Come Si Diventa Genetista Veterinario?
Essere un veterinario, essere educato in genetica medica ed essere pronto a cercare opportunità in ruoli veterinari non tradizionali, sarebbe tutto adatto. Da quel momento, è esattamente quello che sono i tuoi talenti. L’altra nostra genetista veterinaria, Kate Robinson, ha una serie di compiti leggermente diversi. Ha più esperienza di me con allevatori e club di razza, quindi lavora con loro molto più di me. È stata anche educata clinicamente mentre io ho un background scientifico di base, in modo che si occupi di questioni di natura più clinica.
In Che Modo Il Test Del DNA Del Cane Può Differire Dal Test Del DNA Umano?
Non lo è davvero, in realtà. La differenza sta nella struttura della popolazione del cane domestico rispetto all’anatomia umana. A differenza degli umani, le razze di cani domestici sono sviluppate attraverso una forte selezione positiva per tratti specifici. Ad esempio, le adorabili zampe corte del Bassotto, o l’acume da pastore di questo Border Collie. A livello molecolare, questo ha portato alla selezione di enormi tratti di DNA e ha fornito a ogni razza di cane la propria coppia di firme genetiche, o esattamente ciò che i genomici chiamano aplotipi.
La cosa bella del tuo cane è che quegli aplotipi sono incredibilmente estesi. È possibile immaginare che se hai scelto per una mutazione che controlla le gambe corte per secoli, porterai con te anche tutte le mutazioni nelle vicinanze. Ciò significa che una mutazione può spesso prevedere la disposizione della mutazione successiva perché stanno arrivando tutte in un grande pezzo di DNA. Chiamiamo questo specifico linkage disequilibrium, in cui le mutazioni o le variazioni genetiche non si segregano indipendentemente l’una dall’altra.
Ma tornando a come questo differisce tra cani e umani in base alla razza del cane, lo squilibrio di collegamento nel cane è lasciato fino a 100 volte maggiore di un umano. Ciò significa che con un chip di polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) meno compatto, possiamo ancora identificare il ceppo così come un chip SNP umano può individuare l’etnia. Il processore Embark SNP ha oltre 200.000 SNP (ritengo che alcuni dei chip SNP umani abbiano consumato fino a cinque volte tanto). Sarebbe bello avere una politica più alta (non si possono mai avere troppe informazioni!). Ma a causa della struttura della popolazione unica delle razze canine, in realtà non ne abbiamo bisogno per identificare la razza con grande precisione.
Quanto è Specifico E Accurato Un Test Del DNA Quando Si Differenziano I Cani Di Razza Mista?
Promettiamo una precisione al livello dei bisnonni (12,5%) ma spesso possiamo scendere a circa il 5% di contributo di razza. Ora, a seconda del cane, ciò potrebbe significare che il DNA del tuo cane è coerente con l’uso di un bisnonno di Chow Chow o potrebbe significare che il tuo cane probabilmente aveva bisogno di un mix di Chow Chow per ottenere un bisnonno o a volte significa che il bisnonno del tuo cane era molto probabilmente una razza mista. Questo dipende davvero da quanto è misto il cane.
In precedenza, ho menzionato come la creazione di ceppi canini abbia generato tratti sostanziali di DNA da sottoporre a selezione positiva, generando aplotipi specifici della razza. Se continui a trasformare un cane di razza in un cane di razza della stessa identica razza, quegli aplotipi rimangono intatti attraverso la generazione successiva e la successiva. Tuttavia, una volta che inizi a introdurre altre razze in un cane, questi aplotipi iniziano davvero a rompersi. Ha a che fare con qualcosa chiamato ricombinazione meiotica, che avviene ad ogni produzione nello sperma e negli ovuli. Durante questa procedura, il cromosoma che erediti dalla madre e il cromosoma che erediti da tuo padre si collegheranno e scambieranno le informazioni. Ciò garantisce la diversità genetica all’interno di un’altra generazione ed è il motivo per cui la maggior parte delle persone non assomiglia a repliche esatte dei nostri genitori.
Nei cani di razza, avviene la ricombinazione meiotica, ma poiché i 2 cromosomi sono sostanzialmente identici, si notano pochissime prove di ricombinazione. Nelle razze miste, la ricombinazione porta ad un accorciamento degli aplotipi di ciascuna razza ancestrale. L’accorciamento continuerà con ogni generazione. Se un cane ha antenati di razza mista lungo tutto l’albero genealogico, a volte l’aplotipo diventa così breve che non possiamo assegnarlo in modo univoco a un singolo ceppo. Quella parte del DNA è esattamente ciò che noi di Embark chiamiamo Supermutt. Occasionalmente possiamo identificare doni molto piccoli (circa il 5%) di DNA di razza in una parte di cani Supermutt (se potessimo, informarti bene sui tuoi cani Trace Breeds), tuttavia a volte non possiamo. Scopri di più sui cromosomi nei cani.
Come Puoi Individuare Determinate Razze In Un Cane Di Razza Mista?
Confrontiamo gli aplotipi di cani di razza mista – lunghezza, sequenza e altri attributi – con quelli di famosi purosangue nel nostro pannello di riferimento. Queste informazioni passano attraverso una raccolta di algoritmi che riportano la probabile percentuale che ogni ceppo ha contribuito al mix unico di aplotipi dei cani.
Le Persone Possono Usare I Risultati Di Un Test Del DNA Per Certificare Un Cane Come Purosangue?
No. Ricorda, confrontiamo diversi aplotipi di cani con un gruppo di riferimento di cani di razza e chiediamo la percentuale di aplotipi di cani che sono unici per una razza o per l’altra. Possiamo dire che un cane ha un’intensa somiglianza ereditaria con i nostri Golden Retriever di riferimento, anche se il 100% degli aplotipi corrisponde agli aplotipi noti del Golden Retriever. Ma la genetica da sola non specifica se un cane è di razza.
La certificazione del ceppo puro richiede normalmente un pedigree e documenti di registrazione per i genitori adottivi conosciuti.
Puoi Descrivere Cosa Significa Se Il Tuo Cane Ha Il Lupo In Loro?
Di conseguenza, se il tuo cane ha una percentuale di lupo grigio al suo interno, significa che possiamo davvero individuare gli aplotipi di lupo. Significa che il tuo cane ha il lupo in loro. Evento non insolito.
Se il tuo cane ha un punteggio Wolfiness alto, questa è una domanda completamente diversa. Wolfiness interroga una serie di SNP che sappiamo essere ipervariabili tra cani e gattini. Un certo numero di quelle razze artiche, come il Siberian Huskies e l’Alaskan Malamute, sono inclini ad avere un po’ più di questi SNP rispetto ad altre razze canine, quindi Sibes e Mals sono generalmente circa il 2-4% di Wolfy. A volte prendiamo un cagnolino con il 14% di Wolfiness, ma ciò non significa che abbiano il 14% di lupo. Significa che è stato mantenuto un numero elevato di quegli SNP che sono più prevalenti nei lupi che nei cani.
Quanto Sono Accurati I Risultati Per Determinare Le Mutazioni Genetiche E Le Condizioni Di Salute?
Usiamo diverse sonde per ogni mutazione (quindi garantendo la massima replicabilità dei risultati), quindi per i polimorfismi a singolo nucleotide (SNP e anche da cui prende il nome un processore SNP), la nostra precisione è davvero maggiore del 99,99% . Per varianti strutturali, ad esempio, un inserimento o una cancellazione massiva della sequenza del DNA, o una variazione del numero di copie in cui si vedono quattro copie di una sequenza in 1 cane e cinque in un cane diverso, la nostra precisione è un po’ più bassa, più vicina al 99% . In questi scenari, stiamo lavorando per incorporare dati diversi che informano il primo risultato con una strategia ortogonale come questa, di nuovo la nostra precisione è superiore al 99,99%.
Ricorda tuttavia che una risposta ereditaria non è una diagnosi di malattia. In realtà, molte delle mutazioni mostrate da Embark sono note per avere una penetranza incompleta, il che significa che anche se un cane è in pericolo per una condizione non significa che sia un affare fatto e il cane svilupperà lo stato di salute.
Video: Risultati E Salute Del Test Del DNA Del Cane
Guarda questo breve video di 20 secondi che mostra una registrazione del modo in cui visualizzare le informazioni sulla salute dei tuoi cani quando vengono visualizzati i risultati del test Embarks.
Cosa Succede Se I Proprietari Lo Fanno Se Vengono Rilevati Determinati Rischi Per La Salute?
Parla con il proprio veterinario, parla con il proprio veterinario, parla con il proprio veterinario. Sul serio. Embark è una società di test del DNA. Non c’è assolutamente alcun sostituto per una valutazione medica del tuo cane.
Cosa Separa I Migliori Test Del DNA Per Cani Dal Resto?
Metodologia di livello di ricerca per l’identificazione della razza, test sanitari approfonditi e i migliori servizi ai clienti. Ottenere tutte queste informazioni può essere uno shock enorme. Abbiamo scienziati e veterinari a disposizione per aiutarti a interpretare i tuoi risultati e anche a dare un senso a tutto ciò. Inoltre, la
nostra dedizione a portare avanti la ricerca sulla genetica dei cuccioli . Le radici di Imbarca si trovano nello studio della scienza di base È da dove veniamo. La stragrande maggioranza dei nostri clienti ha deciso di prendere parte alla ricerca, il che significa che i dati accumulati dai nostri cani Embark possono essere utilizzati per fare nuove scoperte genetiche sui nostri migliori amici! E poiché Embark raccoglie così tante informazioni per cane in contrasto con altre valutazioni genetiche, stavamo scavando una grande quantità di intriganti associazioni genetiche!
Dove Visiteresti Il Test Del DNA Del Cane In Futuro?
Accidenti, credo che stessimo vedendo solo l’inizio. Con la quantità di informazioni che stavamo creando e l’entusiasmo dei nostri clienti, credo che avremo la capacità di iniziare a rispondere ad alcune domande davvero importanti per i cani e i loro umani. Quali sono i fattori di rischio ereditari che sono alla base dei tumori comuni, o di determinati comportamenti, o delle malattie della tiroide? Diverse razze di cani hanno conosciuto predisposizioni in molte delle suddette.
Da Quel Momento, Possiamo Usare Il Test Del DNA Come Strumento Medico?
Voglio dire, lo facciamo già! I veterinari usano già la razza canina come parte del loro segnale clinico. L’inizio di ogni caso di cani inizia con qualcosa del tipo: Harley è una miscela di Staffy femmina sterilizzata di due anni. Harley è il cane del nostro CEO ed è stato tamponato più volte di quanto possiamo contare. Naturalmente, è stata Embarkd, quindi ora, possiamo effettivamente affermare, Harley è una femmina sterilizzata di due anni, mix di Staffordshire Terrier-Great Pyrenees-Golden Retriever-Australian Cattle Dog. Mentre c’è un po ‘più di un boccone, i dati sono maggiori. Grandi Pirenei, Golden Retriever, Australian Cattle Dogs; hanno la loro serie di disturbi e considerazioni che un veterinario inizierà a incorporare nell’immagine clinica, insieme a tutte le informazioni sulla malattia e sui tratti che il test del DNA può fornire.
Scopri di più su Embark, incluso il motivo per cui sono la nostra prima scelta nelle nostre recensioni sui test del DNA per cani.
Di che razza credi davvero che sia il tuo cane? È già stato testato?
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